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Text File  |  1995-03-04  |  1.4 KB  |  29 lines
  1. ******************************************************
  2. * Eukaryotic initiation factor 5A hypusine signature *
  3. ******************************************************
  4.  
  5. Eukaryotic initiation factor 5A (eIF-5A) (formerly known as eIF-4D) [1,2] is a
  6. small protein whose precise role in the initiation of protein synthesis is not
  7. known. It appears to promote the formation of the first peptide bond.   eIF-5A
  8. seems to be the  only  eukaryotic  protein  to  contain  an  hypusine residue.
  9. Hypusine is  derived  from  lysine  by  the  post-translational  addition of a
  10. butylamino group (from spermidine) to the epsilon-amino group of lysine.   The
  11. hypusine group is essential to the function of eIF-5A.
  12.  
  13. A hypusine-containing protein  has been found in the archaebacteria Sulfolobus
  14. acidocaldarius; this  protein  is    highly similar to eIF-5A and could play a
  15. similar role in protein biosynthesis.
  16.  
  17. The signature we developed for eIF-5A is centered around the hypusine residue.
  18.  
  19. -Consensus pattern: T-G-K-H-G-x-A-K
  20.                     [The first K is modified to hypusine]
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23. -Last update: June 1994 / Text revised.
  24.  
  25. [ 1] Park M.H., Wolff E.C., Folk J.E.
  26.      Biofactors 4:95-104(1993).
  27. [ 2] Schnier J., Schwelberger H.G., Smit-McBride Z., Kang H.A., Hershey J.W.B.
  28.      Mol. Cell. Biol. 11:3105-3114(1991).
  29.